Werner Elert (19. elokuuta 1885 Heldrungen am Kyffhäuser – 21. marraskuuta 1954 Erlangen) oli saksalainen evankelisluterilainen teologi.

Werner Elert on luterilaisuuden tutkija, joka edustaa Luther-tutkimuksen systemaattista näkökulmaa.^[1] Werner Elert tuki kansallissosialistista valtiota ja saksalaisuuden ihannetta. Hänen mukaansa Jumala on luonut pysyviä järjestyksiä, kuten avioliitto, perhe ja omaisuus – joissain tapauksissa myös kansa, valtio ja rotu, joiden varassa oikea elämä on mahdollista.^[2]