Rautoman dokumenttielokuva Fustatin lapsia palkittiin sarjansa parhaana Leipzigin elokuvajuhlilla 1986.[2] Vuonna 1977 Rautoma palkittiin yhdessä Heikki Partasen ja Katariina Lahden kanssa Jussilla parhaasta ohjauksesta elokuvassa Antti Puuhaara.
Parhaan tuottajan Jussi-palkinnon Rautoma ja Partanen saivat vuonna 1982 elokuvasta Ramses ja unet.[1].