Tämä on luettelo Indonesiassa sijaitsevista kaupungeista.

• Balikpapan
• Banjarmasin
• Palangkaraya
• Pontianak
• Martapura
• Samarinda
• Tarakan

• Ambon
• Sofifi
• Ternate

• Mataram
• Kupang
• Dompu
• Sumbawa Besar

• Jayapura
• Timika
• Manokwari
• Kota Biak
• Enarotali
• Fak Fak
• Merauke
• Sorong
• Wamena

• Bau-Bau
• Bulukumba
• Gorontalo
• Makassar (Ujung Pandang)
• Mamuju
• Manado
• Palu
• Poso
• Pare-Pare
• Kendari
• Palopo
• Malili

• Banda Aceh
• Bandar Lampung
• Batam
• Bengkulu
• Bukittinggi
• Dumai
• Jambi
• Lampung
• Medan
• Padang
• Pangkal Pinang
• Pekanbaru
• Palembang
• Sibolga
• Sungailiat
• Tanjung Pinang