Heksaani on terveydelle haitallista, tulenarkaa sekä ympäristölle haitallista. Yhdistettä esiintyy semiokemikaalina eliöiden viestinnässä sekä kasvien tuoksuissa.
Kaupallisessa heksaanissa on n-heksaania 40–50 % ja siinä esiintyy myös muitakin C6-hiilivetyjä – kuten bentseeniä. Puhdasta n-heksaania saa lähinnä vain laboratoriokemikaalina.