Mohnhaupt sotkeutui vapautumisensa jälkeen useiden merkkihenkilöiden surmiin sekä muihin terroritekoihin. Hänet pidätettiin Jugoslaviassa11. toukokuuta1978, mutta hän sai poistua maasta saman vuoden marraskuussa. 15. syyskuuta1981 Mohnhaupt osallistui salamurhayritykseen Yhdysvaltain kenraali Frederick Kroesenia vastaan.
Mohnhaupt pidätettiin jälleen 1982, jolloin hän sai viisi elinkautista vankeusrangaistusta. Hänelle myönnettiin armahdusmahdollisuus 24 vuoden vankeuden jälkeen.
Mohnhauptin armahduksesta sovittiin oikeuden päätöksellä helmikuussa 2007. Saksan hallitus vältti kommentoimasta tapausta. Mohnhaupt vapautettiin lopulta Aichachista 25. maaliskuuta 2007.[1]