1. FFC Frankfurt perustettiin 27. elokuuta1998,[1] kun naisten jalkapallojoukkue eriytyi SG Praunheimista itsenäiseksi seuraksi. Virallisesti seuran nimi muuttui vuoden 1999 alusta, ja se voitti heti kauden päätteeksi ensimmäisen mestaruutensa. Sen jälkeen Frankfurt on hallinnut Saksan sarjoja ottaen lukuisia mestaruuksia ja cup-voittoja. Seuran merkittävin kotimainen kilpailija on entinen DDR:n mestari 1. FFC Turbine Potsdam.
1. FFC Frankfurt on menestynyt myös Naisten UEFA Cupissa. Seura voitti kaikkien aikojen ensimmäisen naisten cupin kaudella 2001–2002 kaatamalla Umeå IK:n Frankfurtissa pelatussa finaalissa 2-0. Kaikkiaan UEFA Cupin tai mestarien liigan seuralla on neljä.