2000. urtearen amaieran, Martha Hildebrandt kargugabetu ondoren, Kongresuko lehendakari izendatu zuten, Alberto Fujimoriren dimisioa eta ondorengo kargugabetzea, Peruko Errepublikako bitarteko presidente izendatu zuten 2000ko azaroaren 22tik 2001eko uztailaren 28ra arte, Alejandro Toledo Manrique-k irabazi zituen presidentetzarako hauteskundeak egiteko helburuarekin.
Errepublikako lehendakaritza utzi zuenetik bost urte igaro ondoren, bere osasun egoera delikatuagatik ospitaleratu ostean, 2006ko abuztuaren 21etik urriaren 16ra, azken egunean hil zen goizeko 5:00etan, biriketako konplikazioen eta bihotzeko baten biktima.