22. juulil pöördus jäägrite ülem Asso Kommer peaminister Mart Laari poole, kurtes väeosas Paldiskis halbu majutus- ja olmetingimusi. Samal päeval tutvusid Paldiski oludega kaitseväe juhataja Aleksander Einseln, peastaabi ülem Ants Laaneots ja siseminister Lagle Parek.
23. juulil andis kaitseväe juhataja Aleksander Einseln käsu vabastada Kommer ülema kohalt ja saata ta ohvitseride väljaõppe- ja täienduskursustele. Kompanii ülema ajutiseks kohusetäitjaks määrati Jaak Mosin. Kommer keeldus allumast kaitseväe juhataja korraldusele ning väeosast lahkumast. Peaminister Laar lendab Inglismaale puhkusele.
25. juulil teatasid jäägrid, et nemad kui vabatahtlikest koosnev Kaitseväe koosseisus olev relvastatud üksus väeosa lahkuvad Eesti riigi kaitsejõudude koosseisust.
27. juulil saatis Eesti Vabariigi Valitsus jäägerkompanii laiali. Jäägrid keeldusid korraldusele allumast ning lahkusid järgmisel päeval Paldiskist Pullapääle. Jägalasse saabusid Võrustsoomukid ja kuperjanovlased. Jäägrikompanii juhtkond otsustas luua kompanii baasil Eestimaa Vabatahtliku Jäägrikompanii. Järgmistel päevadel kogunes Pullapääle jäägrite poolehoidjaid, kaitseliitlasi ja naisi.
2. augustil vahistas Kaitsepolitsei Haapsalus jäägrite ülema asetäitja Jaak Mosina. Puhkuselt naasenud peaminister Mart Laar otsustas Jäägrite laialisaatmise peatamise ja valitsuse erikomisjoni loomise. Jäägrid võtsid tagasi 25. juuli avalduse.
4. septembril viivad kolm meest Tallinnast autoga kaasa ärimehe Pavel Kalmõkovi, kes jääb kadunuks. Üks ebaseaduslik vabaduse võtja oli Asso Kommer. 9. detsembril näitas Kommer uurijatele koha, kuhu Kalmõkovi laip maeti.
7. septembril Valitsuskomisjon esitas aruande Läänemaa Vabatahtliku Jäägrikompanii vastuhaku asjaoludest. Valitsus otsustas jäägrikompanii ümber formeerida. Kompaniiülemaks määrati Riho Ühtegi.
12. septembril põgenes augusti keskel vahi alt vabastatud Mosin Rootsi ja palus poliitilist varjupaika.
Kohus mõistis mitmetes kuritegudes süüdistatud Kommeri kuueks aastaks ja kuueks kuuks vangi 26. novembril 1993. Ametlik vanglakaristus oleks lõppenud tal 26. mail 2000. Kommer kandis alguses karistust Pärnus. Viimase aasta oli ta Tallinna keskvanglas ja vabanes 1998. aastal.