II liiga 2016 oli Eestijalgpalli tugevuselt neljanda liiga II liiga2015. aasta hooaeg, mis jagunes kahte tsooni - ida/põhi ja lõuna/lääs. Hooaeg algas 25. märts 2016 ja lõpeb 23. oktoober 2016.
Hooaja lõpus osalevad II liiga ida/põhi 12. koht ja III Liiga ida ning põhja tsoonide 2. kohad üleminekumängudel, mille võitja mängib järgmisel hooajal II liigas ning kaotajad III liigas. Kõigepealt mängivad omavahel III Liiga ida ning põhja tsoonide 2. ning seejärel mängib nende mängude võitja II liiga ida/põhi 12. kohaga.
Allikas: Eesti Jalgpalli Liit 1Kodu meeskond on vasakus tulbas. 2Võru JK andis loobumiskaotuse. 4Mängutulemus tühistatud - Tabasalu JK Charma võistkonna koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Risto Tämmo. 5Mängutulemus tühistatud - Tartu FC Santos II võistkonna koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Marten Zovo. 6Mängutulemus tühistatud - Tabasalu JK Charma võistkonna koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Kersten Lõppe. 7Kuusalu JK Rada andis loobumiskaotuse. 8Mängutulemus tühistatud: võistkonna Võru JK koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Kristjan Kimmel. 9Mängutulemus tühistatud: võistkonna Võru JK koosseisus osales mänguõigust mitteomav mängija Eduard Desjatski. 10Mängutulemus tühistatud: võistkonna Võru JK koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Tarvo Piho. 11Tabasalu JK Charma andis loobumiskaotuse. 12Mängutulemus tühistatud - Kiviõli FC Irbis võistkonna koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Aleksandr Sojunen. 13Mängutulemus tühistatud - võistkonna Kiviõli FC Irbis koosseisus osales mänguõigust mitteomav mängija. Värvid:: Sinine = Kodu meeskonna võit; Kollane= viik; Punane = võõrsil meeskonna võit.
Reeglid paremusjärjestuse määramiseks:1) punktid; 2) vähem loobumiskaotusi/tühistatud tulemusi; 3) punktid omavahelistest mängudest;
4) väravate vahe omavahelistest mängudest; 5) võidud; 6) üldine väravate vahe; 7) löödud väravad; 8) võõrsil löödud väravad; 9) loosimistulemus;
Kui hooaja lõpus kaks (või enam) võistkonda jagavad võrdsete punktidega esikohta viiakse meistri selgitamiseks nende vahel läbi lisamäng (turniir).[1] (M) = Meister; (LV) = Langes liigast välja; (E) = Edutatud; (ÜV) = Üleminekumängude võitja.
II liiga lõuna/lääs üleminekumängud
Hooaja lõpus osalevad II liiga lõuna/lääs 12. koht ja III Liiga lõuna ning lääne tsoonide 2. kohad üleminekumängudel, mille võitja mängib järgmisel hooajal II liigas ning kaotajad III liigas. Kõigepealt mängivad omavahel III Liiga lõuna ning lääne tsoonide 2. ning seejärel mängib nende mängude võitja II liiga lõuna/lääs 12. kohaga.
Allikas: Eesti Jalgpalli Liit 1Kodu meeskond on vasakus tulbas. 3Mängutulmus tühistatud - Keila JK mängus osales diskvalifitseeritud mängija Tauri Tamkivi. 4Mängutulemus tühistatud - Tallinna FC Forza võistkonna koosseisus osales diskvalifitseeritud mängija Valentin Ivanov. 5FC Kose andis loobumisvõidu. 6Tallinna FC Ararat TTÜ andis loobumiskaotuse. 7Tallinna FC Forza andis loobumiskaotuse. 8SK Imavere Forss andis loobumiskaotuse.
Värvid:: Sinine = Kodu meeskonna võit; Kollane= viik; Punane = võõrsil meeskonna võit.