En su juventud, Cílek se mudó a Tanzania, donde su padre trabajaba como geólogo. De 1969 a 1970 estudió en un instituto de Tanzania[2] y más tarde continuó sus estudios en la Escuela Técnica de Minería en Příbram (1970-1974). En 1979 se graduó en geología en la Universidad Carolina de Praga[2] Desde 1980, trabaja en el Instituto Geológico de la Academia Checa de Ciencias donde se especializó en geología de la Era Cenozoica, centro que dirigió entre 2004 y 2012. También explora las interacciones entre el medio ambiente y la civilización.
En 2004, Cílek recibió el premio Tom Stoppard por sus libros Krajiny vnitřní a vnější (2002) y Makom: Kniha míst (2004).[4] Además, fue nombrado Laureado por el ministerio de Ecología por su «valiosa contribución a la divulgación de la ciencia checa, especialmente la geología y la climatología» (2007).[4] En 2009, recibió el premio VIZE 97 (en checo, Cena Nadace Dagmar a Václava Havlových VIZE 97) que otorga la Fundación Dagmar y Václav Havel VIZE 97.[5]
