Hijo de Rafael Calderón Muñoz y Ana María Guardia Mora, se casó en primeras nupcias con la aristócrata belgaYvonne Clays Spoelders, quien fue la primera mujer que participó en la actividad diplomática costarricense, y en segundas con María del Rosario Fournier Mora, costarricense.
Estudió medicina en Francia y Bélgica. Estando en ese país, conoció la doctrina social de la Iglesia Católica (conocida hoy en día como socialcristianismo), que fue su guía para asumir una posición política e ideológica en favor de los más necesitados del país. A su compromiso con esta ideología contribuyeron también el pensamiento de su padre, el Doctor Calderón Muñoz, y de su suegro belga Joseph Clays.
En 1927, poco después de su matrimonio con Yvonne, dio su regreso a Costa Rica y se dedicó al ejercicio de su profesión. Llegó a ser Cirujano Jefe del Hospital San Juan de Dios. Mientras ejercía su labor en los años 1930, en la que ganó fama de hombre generoso y caritativo, participó activamente en política y fue Diputado por San José y Presidente del Congreso Constitucional. En 1940, con el apoyo del gobierno de León Cortés Castro, fue elegido Presidente de la República.
Logró que le sucediera Teodoro Picado Michalski, que gobernó de 1944 a 1948 bajo el control de los partidarios de Calderón y del Partido Comunista. De 1944 a 1946 residió en Nueva York.
En las elecciones de 1948 fue nuevamente candidato a la presidencia. Se respiraba un ambiente muy tenso debido a las acusaciones mutuas entre los oficialistas y la oposición sobre un posible fraude electoral (tan común en esa época), aunado a los llamamientos, que desde el interior del país hacía José Figueres Ferrer y su Legión del Caribe (quienes habían prometido derrocar a algunas dictaduras de Latinoamérica principalmente la de Somoza en Nicaragua y la de Trujillo en República Dominicana) para lo cual tenían organizado un ejército de mercenarios listos para la acción y esperando la chispa que encendiera el conflicto que sucedió a continuación. El Gobierno en un intento de apaciguar los ánimos, decidió dejar en manos de la oposición la organización de los comicios de 1948 donde el Tribunal Nacional Electoral declaró provisionalmente electo al candidato opositor, el periodista, Otilio Ulate Blanco. Sin embargo dicha declaratoria se dio fundamentada en los resultados dados en los telegramas enviados por las respectivas juntas receptoras de votos y antes de poder confirmar con el conteo manual el resultado, sucedió un siniestro en el Colegio Superior de Senoritas donde se quemaron, de forma aún no esclarecida, las papeletas para Presidente; entonces el doctor Calderón Guardia presentó al Congreso una demanda de nulidad de las elecciones presidenciales, aunque no de las legislativas, en las que sus partidarios sí habían obtenido mayoría. El 1 de marzo de 1948 el Congreso, donde la alianza de calderonistas y comunistas tenía mayoría, anuló las elecciones presidenciales. Esto detonó aquella chispa que provocó una guerra civil, en la cual (tras algunos hechos de sangre y la espectacular toma de Cartago, segunda ciudad del país, por parte de los rebeldes del Ejército de Liberación Nacional) las fuerzas del gobierno fueron derrotadas, tras pactar Jose Figueres Ferrer con los comunistas de Manuel Mora quienes controlaban la defensa oficial de la capital. Calderón entonces tuvo que exiliarse primero en Nicaragua y posteriormente se trasladó con su familia a México. En 1949 y 1955 trato de recuperar el poder por la fuerza pero fracasó en el intento.
En 1958 Rafael Ángel regresó pacíficamente al país que lo recibió con vítores, para ser diputado en el gobierno de Mario Echandi Jiménez, aunque no ejerció el cargo. Fue candidato a la presidencia otra vez en 1962, y a pesar de su derrota, hasta su muerte continuó siendo una figura política muy influyente. Fue Embajador de Costa Rica en México de 1966 a 1969.
El museo Dr. Rafael Calderón Guardia, ubicado en Barrio Escalante, San José, fue creado con la misión de recuperar, preservar y de divulgar la vida y obra de Calderón Guardia. Fue creado en 1991 como institución adscrita al Ministerio de Cultura y Juventud.[1]
Principales Logros
Se promulgó la Ley de Industrias Nuevas en 1940
Se creó la Sociedad Costarricense de Geografía e Historia en julio de 1940[2]