Después de más de una privación en la infancia y la adolescencia, la piadosa princesa tuvo que acostumbrarse a una corte relativamente rica y un esposo amante de la diversión. El matrimonio seguía siendo feliz, y Luisa Juliana estaba entregada a su familia.
Luisa Juliana y Federico IV del Palatinado tuvieron ocho hijos:
A la muerte de su marido en 1610, gobernó en nombre de su hijo, Federico V, conocido como "rey de un invierno", pero el tutor principal fue el duque Juan II del Palatinado-Zweibrücken. Después de un año, su hijo fue declarado mayor de edad y Luisa Juliana lo envió a completar su educación en la corte de su hermana, Isabel de Nassau, en Sedán.
Cuando el emperador Matías de Habsburgo murió en 1619, el reino de Bohemia le ofreció el trono a su hijo, Federico V del Palatinado, el 24 de agosto de 1619. Ella aconsejó a su hijo, sin éxito, de que no aceptara la corona. Después de la aventura en Bohemia, la familia electoral tuvo que huir de las tropas imperiales del Palatinado.