El glaciar es tributario del río Shigar, que desemboca en el río Indo. A su vez, en el Baltoro desembocan varios glaciares: el Godwin-Austen, que fluye desde el sur del K2; el Abruzos y varios glaciares del Gasherbrum, provenientes del grupo de picos del Gasherbrum; el glaciar de Vigne, que viene del Chogolisa; y el glaciar de Yermandendu, que comienza en la zona del Masherbrum. La confluencia del Baltoro con el glaciar Godwin-Austen se conoce como Concordia; este lugar y el campamento base del K2 son destinos populares de senderismo.
La parte final del glaciar es muy ancha y su parte central es un extenso campo de nieve. Pequeños glaciares van desembocando, creando cascadas de hielo en el punto de unión. Las paredes laterales tienen notables pendientes, llegando a ser precipicios. El glaciar ha esculpido a su paso estrías en las rocas, y el hielo en movimiento ha formado depresiones que se han convertido en numerosos lagos glaciales. Puede accederse al glaciar por la ciudad balti de Skardu.
Lista de picos
La lista de montañas más importantes cercanas al glaciar incluye:
K2, segundo pico más alto del mundo, 8611 m de altura medida a nivel del mar.
Gasherbrum I, undécimo pico más alto del mundo, con 8080 m de altura medida a nivel del mar.
Broad Peak, duodécimo monte más alto del mundo, con 8047 m de altura medida a nivel del mar.
Gasherbrum II, decimotercer monte más alto del mundo, con 8035 m de altura medida a nivel del mar.
↑El glaciar Fedchenko, en las montañas del Pamir, de Tayikistán, mide 77 km de largo; el glaciar de Siachen, que se encuentra al sureste del Baltoro, tiene 70 km de longitud; y el glaciar Biafo, al noroeste del Baltoro, tiene 63 km de largo. La longitud exacta es bastante fácil de determinar con las modernos mapas e imágenes de satélite, incluso para determinar el retroceso ocurrido en los últimos años. Las mediciones provienen de imágenes recientes, complementadas con mapas topográficos rusos a escala 1:200.000, así como mapas de Jerzy Wala, Esbozos de mapas orográficos: Karakórum: Hojas 1 y 2, Fundación suiza para la investigación alpina, Zúrich, 1990.