El organismo surgió a partir de la Unión Sahel-Benín de corta vida que había sido creada por cuatro miembros originales del Consejo y sucedió parcialmente a la disuelta federación colonial francesa de África Occidental Francesa.
Desde 1966, el Consejo ha contado con una secretaría administrativa permanente en Abiyán, la ciudad más grande de Costa de Marfil. A partir de un fondo mancomunado, se creó el Fondo de Ayuda Mutua y Garantía de Préstamos con la finalidad de asistir a los miembros más pobres.