Se sitúa en la costa sudoeste de Cuba que, junto con la isla de la Juventud (que forma parte del archipiélago) cierra por el sur el amplio golfo de Batabanó. Sus abundantes cayos se extienden a lo largo de unos 150 km de longitud, sobre un mar de escasa profundidad.
Este archipiélago, que pertenece por entero al municipio especial de Isla de la Juventud, constituye un rosario de islas e islotes de origen reciente (creado durante el Cuaternario), formados casi exclusivamente por calizas y con dimensiones muy reducidas. Destacan islas como Mangles y cayos como los del Hambre, Alacranes, Manteca, Inglesitos, Bocas de Alonso, Aguardiente, Cantiles, Rosario y Largo del Sur, este último el único habitado. Predomina una vegetación de manglar, refugio de fauna marina y de aves como flamencos y cotorras.