Ekzistas du, ekzakte samrajtaj, ŝtataj flagoj de Bavario en la landaj koloroj bluo kaj blanko. Ambaŭ en sia nuna formo oficialiĝis la 16-an de novembro 1953. Unu el ili estas simpla dukolora flago horizontale blanka-blua. La alia, pli specifa, konsistas el pluraj klinitaj romboj blankaj kaj bluaj. Ne ekzistas "ofica flago": la landaj instancoj rajtas libere elekti kiun el la du oficialaj flagoj uzi. Ofte bildiĝas flagaj variaĵoj, kiuj centre aldone metas la blazonon de Bavario - tamen neniu el ili oficialas, kaj oficiale eĉ malpermesatas, sed tamen la oficialaj instancoj toleras la uzon de tiuj "inventaĵoj" kaj ne persekutas ĝin.