Το Αρχαιολογικό Μουσείο της Μήλου βρίσκεται στην Πλάκα Μήλου, στην Ελλάδα και στεγάζεται σε νεοκλασικό κτίριο του 1870, έργο του Ερνέστου Τσίλλερ. Το μουσείο άρχισε να λειτουργεί το 1985 και υιοθετεί εκθέματα που χρονολογούνται από τα ύστερα Νεολιθικά έως τη Βυζαντινή περίοδο.