Το Κύπελλο Ερασιτεχνικών Ομάδων Ε.Π.Σ. 2016–17 είναι η 44η διοργάνωση του θεσμού του Κυπέλλου Ερασιτεχνών. Την πρώτη φάση αποτελούν οι διοργανώσεις των κυπέλλων των κατά τόπους Ενώσεων Ποδοσφαιρικών Σωματείων. Οι κυπελλούχες ομάδες των τοπικών ενώσεων αγωνίζονται στη δεύτερη φάση του Κυπέλλου Ερασιτεχνών, με διοργανώτρια αρχή την Ελληνική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία.[1] Η νικήτρια ομάδα αποκτά το δικαίωμα συμμετοχής στο Σούπερ Καπ Ερασιτεχνών με αντίπαλο τη νικήτρια του Κυπέλλου Γ΄ Εθνικής 2016–17. Η κλήρωση της δεύτερης φάσης ήταν προγραμματισμένη για τις 23 Μαρτίου,[2] αλλά τελικά πραγματοποιήθηκε στις 28 Μαρτίου του 2016.[3][4]
Ομάδες
Οι ενώσεις ποδοσφαιρικών σωματείων χωρίζονται σε εννέα ομίλους με βάση τη γεωγραφική τους θέση. Κάθε ομάδα μετέχει στον όμιλο στον οποίο βρίσκεται η ένωση στην οποία ανήκει.
Στην προημιτελική φάση κληρώθηκαν οι νικήτριες του 1ου, 2ου, 3ου, 4ου, 7ου, 8ου και 9ου ομίλου, με τη νικήτρια του αγώνα της ενδιάμεσης φάσης να εισέρχεται εν συνεχεία. Οι αγώνες ορίστηκαν για τις 3 Μαΐου του 2017.
