* Οι συμμετοχές και τα γκολ στις προηγούμενες ομάδες υπολογίζονται μόνο για τα εγχώρια πρωταθλήματα και έχουν ανανεωθεί έως 7 Οκτωβρίου 2023.
† Συμμετοχές (Γκολ).
Το 1998 ο Έντο υπέγραψε το πρώτο του επαγγελματικό συμβόλαιο με το σύλλογο Γιοκοχάμα Φλούγκελς. Η ομάδα συγχωνεύτηκε σχεδόν αμέσως με τη Γιοκοχάμα Μαρίνος, και το 2001 υπέγραψε με την Γκάμπα Οσάκα, όπου ανήκε μέχρι και το 2021. Στην Γκάμπα ο Έντο γνώρισε μεγάλες επιτυχίες και καθιερώθηκε ως ένας από τους καλύτερους παίκτες στο ιαπωνικό πρωτάθλημα από τα μέσα της δεκαετίας του 2000 έως τις αρχές της δεκαετίας του 2010. Κατέκτησε δύο πρωταθλήματα Ιαπωνίας (2005, 2014) και τέσσερα Κύπελλα (2008, 2009, 2014, 2015).[2] Επιλέχθηκε δώδεκα φορές στην καλύτερη ομάδα του πρωταθλήματος, ενώ γνώρισε και διεθνή επιτυχία με την κατάκτηση του Ασιατικού Τσάμπιονς Λιγκ το 2008.[3]
Στις 24 Νοεμβρίου 2009 λαμβάνει στη Κουάλα Λουμπούρ το βραβείο του παίκτη της χρονιάς από την Ασιατική Συνομοσπονδία Ποδοσφαίρου.[4] Στις 5 Οκτωβρίου 2020 και σε ηλικία 40 ετών δίνεται δανεικός στη Τζούμπιλο Ιβάτα της δεύτερης κατηγορίας με στόχο να βοηθήσει την άνοδο της ομάδας στην πρώτη κατηγορία, κάτι που τελικά επιτεύχθηκε και ο παίκτης παρέμεινε στο σύλλογο και για την επόμενη χρονιά.[5][6]
