Secretan schloss im Jahre 1870 das Lizenziat der Rechte an der Universität Lausanne ab und erlangte 1876 das Anwaltspatent. Er arbeitete von 1871 bis 1874 als Sekretär beim Eidgenössischen Politischen Departement und war in Bern als Korrespondent für die Gazette de Lausanne tätig. Er war dort von 1874 bis 1917 als Chefredaktor tätig. Secretan führte die Zeitung zu einer der wichtigsten Zeitungen in der Schweizer Medienlandschaft, sie galt als führende Zeitung der liberalen Opposition gegen die radikale Regierung. Im Jahre 1900 gehörte Édouard Secretan zu den Gründungsmitgliedern des Vereins der Schweizer Presse. Von 1906 bis 1918 war er Mitglied des Verwaltungsrates der Schweizerischen Depeschenagentur.