Die Universidad de Magallanes wurde am 26. Oktober 1981 gegründet, indem die 1961 von der Universidad Técnica del Estado de Chile in Punta Arenas eröffnete Zweigstelle für Ingenieurwesen in eine eigenständige Universität umgewandelt wurde. Im Dezember 1996 errichtete sie zusätzlich ein Studienzentrum in Puerto Natales[1] sowie 2014 ein weiteres in Coyhaique[2] und im Mai 2023 das Centro Subantártico Universitario Cabo de Hornos (Subantarktisches Studienzentrum Kap Hoorn) in Puerto Williams.[3] Das Letztere ist das südlichste Universitätsgebäude in Amerika.