Soisy-Bouy liegt etwa 80 Kilometer ostsüdöstlich von Paris. An der nordwestlichen Gemeindegrenze verläuft das Flüsschen Ruisseau des Méances. Umgeben wird Soisy-Bouy von den Nachbargemeinden Chalautre-la-Petite im Norden und Nordosten, Sourdun im Osten und Nordosten, Hermé im Osten und Südosten, Gouaix im Süden, Chalmaison im Südwesten, Longueville im Westen sowie Sainte-Colombe im Nordwesten.