San Miguel liegt im südlichen Teil der kargen Hochebene des bolivianischen Altiplano. Das Klima ist wegen der Binnenlage kühl und trocken und durch ein typisches Tageszeitenklima gekennzeichnet, bei dem die Temperaturschwankungen zwischen Tag und Nacht in der Regel deutlich größer sind als die jahreszeitlichen Schwankungen.
Die Jahresdurchschnittstemperatur liegt bei 13 °C (siehe Klimadiagramm Tupiza) und schwankt nur unwesentlich zwischen 8 °C im Juni/Juli und 16 °C von Dezember bis Februar. Der Jahresniederschlag beträgt nur etwa 300 mm, mit einer stark ausgeprägten Trockenzeit von April bis Oktober mit Monatsniederschlägen unter 10 mm und einer Feuchtezeit von Dezember bis Februar mit 60 bis 80 mm Monatsniederschlag.
Verkehrsnetz
San Miguel liegt in einer Entfernung von 273 Straßenkilometern südlich von Potosí, Hauptstadt des Departamentos.
Von Potosí aus führt die NationalstraßeRuta 14 über Vitichi, Cotagaita und Hornillos nach Tupiza. Vier Kilometer vor Tupiza stößt aus nordwestlicher Richtung die Ruta 21 auf die Ruta 14, der man 16 Kilometer nach Nordwesten bis San Miguel folgt.
Bevölkerung
Die Einwohnerzahl der Ortschaft ist in dem Jahrzehnt zwischen den beiden letzten Volkszählungen um fast ein Fünftel zurückgegangen: