Die Päpstliche Universität Comillas (Spanisch: Universidad Pontificia de Comillas) ist eine päpstliche Universität und eine der berühmtesten akademischen Institutionen in Spanien.
Die Gründung erfolgte am 16. Dezember 1890 in Comillas (Kantabrien) durch Papst Leo XIII. als katholisches Seminar für die Priesterausbildung.
Im Jahr 1968 wurde der vollständige Umzug der Einrichtung nach Madrid entschieden. Hier unterhält die Universität zwei Campus-Einrichtungen, eine im 1908 gegründeten Instituto Católico de Artes e Industrias (ICAI), das als Zentrum für technische Studiengänge fungiert, und eine im Instituto Católico de Administración y Dirección de Empresas (ICADE), dem Zentrum für Rechts- und Wirtschaftswissenschaften.
Es sind ungefähr 10.000 Studenten eingeschrieben. Die Hochschule wird vom Jesuitenorden geleitet und die führenden Mitglieder der Universitätsleitung gehören den Jesuiten an. Rektor und damit administrativer Leiter der Universität ist José Ramón Busto Saiz. Als Vorsitzender des Aufsichtsorgans (Kanzler) fungiert der jeweilige Generalobere der Jesuiten.