Der Ort liegt mitten im Naturpark Oberpfälzer Wald an der Murach. An Pertolzhofen führt der Bayerisch-Böhmische Freundschaftsweg (Radwanderweg) vorbei.
Geschichte
Funde belegen eine Besiedelung der Gegend bereits in prähistorischer Zeit. Eine Ortsgründung um 1000 v. u. Z. wird stark vermutet. Die Familienmitglieder derer von Pertolzhofen (Adelsgeschlecht) siedelten sich um 1109 im Tal der Murach an. Überreste der Kirche stammen von 1150. Die zu Beginn des 20. Jahrhunderts erbaute Bahnstrecke brachte wirtschaftliche Veränderungen. Die auf der Bahnstrecke verkehrenden Züge wurden 1944 mehrere Male durch Tiefflieger angegriffen. Im Frühjahr 1945 wurde ein Lazarett nach Pertolzhofen verlegt, am 23. April kapitulierten die Insassen und ergaben sich der US-Armee.
Durch Pertolzhofen führt die Staatsstraße 2159, die die A 93 über Oberviechtach mit Stadlern verbindet. Außerdem enden die Kreisstraße SAD 39 nach Oberkatzbach und die Gemeindeverbindungsstraße nach Wagnern in Pertolzhofen.
Willibald Adam (* 24. September 1873 in Pertolzhofen; † 8. März 1935 auf Frauenchiemsee), Abt des Klosters Metten und Gründerabt und Apostolischer Administrator des wiedererrichteten Klosters Niederaltaich