Maggie Peren wuchs in Stuttgart auf, ihr Vater ist Psychologe und ihre Mutter Lehrerin. Sie hat eine ältere Schwester. Sie absolvierte von 1993 bis 1996 eine Schauspielausbildung an der Staatlichen Schauspielschule in Manchester.[2] An der Ludwig-Maximilians-Universität in München studierte sie ab 1996 deutsche und englische Literatur mit Nebenfach Psychologie.
2004 führte sie ihre erste Regie. Sie drehte den Kurzfilm Hypochonder mit Matthias Schweighöfer. 2007 folgte ihr erster Kinofilm, Stellungswechsel. Im Jahr 2010 folgte das Flüchtlingsdrama Die Farbe des Ozeans (2011).[3] Der Film wurde beim TIFF (Internationales Filmfestival in Toronto) uraufgeführt und erhielt zahlreiche Preise.
2013 schrieb sie nach Das Phantom ihren zweiten Thriller: Nocebo. Das Drehbuch wurde von Lennart Ruff verfilmt und gewann 2014 den Studenten-Oscar. 2019 schrieb und inszenierte Maggie Peren Hello Again.
2020 entstand nach acht Jahren Arbeit der vierte Kinofilm: Der Passfälscher. Der Film wurde aber auf Grund der Corona-Pandemie verschoben. Er feierte am 13. Februar Premiere als Spezial Gala bei der Berlinale 2022.
Maggie Peren lebt und arbeitet in München und ist Mutter eines Sohnes, der im Oktober 2010 zur Welt kam.