1875 wurde er Leiter des Théâtre-Lyrique; von 1876 bis 1898 leitete er die Opéra-Comique, danach kehrte er an das Théâtre-Lyrique zurück. Unter seiner Leitung wurden mehrere bedeutende zeitgenössische Operetten und Opern uraufgeführt, darunter Hoffmanns Erzählungen von Jacques Offenbach (1881), Lakmé von Léo Delibes (1883), Manon von Jules Massenet (1884, mit Marie Heilbronn in der Hauptrolle) und Le Flibustier von César Cui (1894).
Neben seiner Dirigententätigkeit war Danbé Konzertmeister des Orchestre de la Société des Concerts du Conservatoire und ab 1888 Leiter der Fondation Beaulieu. Er komponierte einige Violinwerke und veröffentlichte eine Violinschule. 1885 wurde er als Mitglied der Ehrenlegion ausgezeichnet.