Im September 2008 wurde von Emden Fahrer beim damaligen Team Rabobank, bei dem er bis zu seinem Karriereende blieb. Mit dem Giro d’Italia 2009 bestriit er seine erste Grand Tour und beendete diese als 161. der Gesamtwertung. In den Folgejahren war er vor allem bei Zeitfahren, insbesondere Prologen erfolgreich. 2010 wurde er niederländischer Meister in dieser Disziplin. In der Saison 2015 konnte er das Einzelzeitfahren der 4. Etappe der Eneco Tour gewinnen und damit sein erstes Rennen der UCI WorldTour.[1] Beim Giro d’Italia 2017 gewann er das Abschlusszeitfahren und errang damit seinen größten Erfolg.[2]
Bei den Straßenradsport-Weltmeisterschaften 2019 in Harrogate errang van Emden mit dem niederländischen Team den Titel in der erstmals ausgetragenen Mixed-Staffel. Seinen letzten Sieg erzielte er bei den niederländischen Meisterschaften im Jahr 2023, bei denen er zum dritten Mal Meister im Einzelzeitfahren wurde.
Bereits im August 2023 kündigte van Emden sein Karriereende zum Ende der Saison an. Zur Saison 2024 wurde er Mitglied der sportlichen Leitung seines ehemaligen Teams.[3][4]
Trivia
Während des Bergzeitfahrens der vorletzten Etappe des Giro d’Italia 2014 hielt er an, um seiner Freundin einen Heiratsantrag zu machen, den diese annahm.[5]