Seit 1. Februar 2016 ist Claussen Beauftragter vom Rat der EKD für Kultur und Leiter des Kulturbüros der EKD in Berlin.[3] Claussen lebt und arbeitet in Berlin und Hamburg.
Claussen schreibt regelmäßig für deutsche Zeitungen und Zeitschriften sowie für verschiedene Anstalten des öffentlich-rechtlichen Rundfunks. Er gehört zum Herausgeberkreis der Predigtstudien.[4]
Werke
Die Jesus-Deutung von Ernst Troeltsch im Kontext der liberalen Theologie. Dissertation. Universität Hamburg 1995/1996. Mohr, Tübingen 1997, ISBN 3-16-146744-2 (Beiträge zur historischen Theologie. 99).
Moritz und der liebe Gott. DTV, München 2004, ISBN 3-423-62168-0 (dtv 62168: Reihe Hanser).
(Hrsg.) Spiegelungen: biblische Texte und moderne Lyrik; eine Anthologie. Pano, Zürich 2004, ISBN 3-907576-72-1.
Glück und Gegenglück: philosophische und theologische Variationen über einem alltäglichen Begriff. Habilitationsschrift. Universität Hamburg 2004/2005. Mohr Siebeck, Tübingen 2005, ISBN 3-16-148679-X.
Die 101 wichtigsten Fragen – Christentum. Beck, München 2006, ISBN 978-3-406-54094-3 (Beck’sche Reihe; 1676). 2. Auflage 2007, 3. Auflage 2008, japanische Ausgabe 2010.
Zurück zur Religion: warum wir vom Christentum nicht loskommen. Pantheon, München 2006, ISBN 978-3-570-55014-4.
O Gott! Warum und wie wir beten – oder auch nicht. DTV, München 2008, ISBN 978-3-423-62365-0 (dtv 62365: Reihe Hanser).
in Zusammenarbeit mit Christof Jaeger: Gottes Häuser oder die Kunst, Kirchen zu bauen und zu verstehen: vom frühen Christentum bis heute. Beck, München 2010, ISBN 978-3-406-60718-9.
Herausgeber in Zusammenarbeit mit Martin Rössler: Große Predigten, 2000 Jahre Gottes Wort und christlicher Protest. Schneider, Darmstadt 2015, ISBN 978-3-650-40071-0.
(hrsg. mit Klaus-Martin Bresgott): Lieb, Leid und Zeit und Ewigkeit. Liederbuch für alle Tage. Kulturbüro des Rates der EKD, Berlin 2020, ISMN979-0-000-00231-9(Suche im DNB-Portal).
Gottes Bilder: Eine Geschichte der christlichen Kunst. C. H. Beck, München 2024, ISBN 978-3-406-82216-2.
Harald Schmidt: Geschichte der Kirchenmusik Ermuntert euch und singt mit Schall. Für Geist, Ohr und Seele sind Helene Fischer und die Fangesänge einfach nicht genug. In: Feuilleton.FAZ, 7. September 2014, abgerufen am 15. November 2016 (Johann Hinrich Claussen legt eine beherzte und kenntnisreiche Historie der Kirchenmusik vor).
Stephan Kosch, Jürgen Wandel: Architektur ist verleiblichte Theologie.zeitzeichen, 22. April 2014, abgerufen am 15. November 2016 (Gespräch mit Propst Johann Hinrich Claussen, Präsident des Evangelischen Kirchbautages, über Heiligkeit von und in Kirchenräumen).