Giancarlo Maria Bregantini trat der Ordensgemeinschaft der Stigmatiner bei, legte am 13. Juni 1974 die Profess ab und empfing am 1. Juli 1978 die Priesterweihe. Von 1976 bis 1987 unterrichtete er Kirchengeschichte am Päpstlichen regionalen Seminar San Pio X in Catanzaro.
Als Wahlspruch wählte er Dominus meus et Deus meus. Am 8. November 2007 wurde er von Papst Benedikt XVI. zum Erzbischof von Campobasso-Boiano ernannt und am 20. Januar des nächsten Jahres in das Amt eingeführt.
Giancarlo Bregantini, der auch als Kritiker der Mafia bekannt ist, verfasste die Texte für die 14 Stationen des Kreuzwegs, den Papst Franziskus am Karfreitag 2014 im Kolosseum betete.[1]
Am 6. Dezember 2023 nahm Papst Franziskus das altersbedingte Rücktrittsgesuch von Giancarlo Maria Bregantini an.[2]