Thomas komponierte Orchesterwerke und Kammermusik, Chorwerke und mehrere Ballette. Sie erhielt u. a. Preise und Auszeichnungen der Siemensstiftung in München, der ASCAP, des National Endowment for the Arts, der American Academy and Institute of Arts and Letters der John Simon Guggenheim Memorial Foundation, der Koussevitzky Foundation und der New York Foundation for the Arts. 2007 war sie mit der Komposition Astral Canticle eine der beiden Finalisten für den Pulitzer-Preis für Musik.
Werke
Vigil, Konzert für Cello und Orchester, 1990
Meditation, Konzert für Posaune und Orchester, 1990, 1995
Chant für Cello und Klavier, 1991, 2002
Incantation für Violine, 1995
Spring Song für Cello, 1995
The Rub of Love für gemischten Chor, 1995
Words of the Sea für Orchester, 1995–96
Alleluia for chorus S.A.T.B., 1996
Psalm 91: Verse 11 für Chor, 1996
Piano Etudes, 1996, 2003, 2005
Spirit Musings für Violine und Kammerorchester, 1997
Love Songs für gemischten Chor, 1997
Orbital Beacons, Konzert für Orchester, 1998
Ceremonial für Orchester, 1999
Ritual Incantations für Cello und Kammerorchester, 1999
Passion Prayers für Cello und sechs Instrumente, 1999
Fugitive Star für Streichquartett, 1999–2000
Sun Threads für Streichquartett, 1999–2002
Aurora für Klavier und Kammerorchester, 2000
Ring Out, Wild Bells, to the Wild Sky für Siopran, Chor und Orchester (Text von Alfred Lord Tennyson), 2000
Song in Sorrow für Sopran, Chor und Orchester, 2000
…a circle around the sun… für Klaviertrio, 2000
Bells Ring Summer für Cello, 2000
Invocations für Streichquartett, 2000
Ring, Flourish, Blaze! Fanfare für Bläserensemble, 2000
among dawn flowers für Sopran und Klavier, 2001
Around Midnight Variation für Klavier, 2001
Daylight Divine für Sopran, Kinderchor und Kammerorchester (Text von Gerard Manley Hopkins), 2001
Prayer Bells für Orchester, 2001
Eagle at Sunrise für Streichquartett, 2001
Murmurs in the Mist of Memory für 11 Solostreicher, 2001
Rumi Settings für Violine und Viola, 2001
Magneticfireflies für for high school band, 2001
Chanting to Paradise für Sopran, gemischten Chor und Orchester, 2002
In My Sky at Twilight für Sopran und Kammerorchester, 2002
Light the First Light of Evening für Orchester, 2002
Sunlight Echoes für Orchester, 2002
Trainwork für Orchester, 2002
Rise Chanting für Streichquartett, 2002
Chanting to Paradise für Sopran, gemischten Chor und Orchester, 2002
Four Basho Settings für Frauenchor, 2002
In My Sky at Twilight für Sopran und Kammerorchester, 2002
Tangle für Orchester, 2003
Canticle Weaving, Konzert für Posaune und Orchester, 2003
