Nach dem Wahlsieg der Labour Party bei den Unterhauswahlen vom 1. Mai 1997 wurde er zunächst Staatsminister im Gesundheitsministerium und anschließend von Dezember 1998 bis Oktober 1999 Chefsekretär beim Schatzkanzler (Chief Secretary to the Treasury). Nach einer weiteren Kabinettsumbildung wurde er am 11. Oktober 1999 Gesundheitsminister in der Regierung von PremierministerTony Blair und behielt dieses Amt bis zu seiner Ablösung durch John Reid am 13. Juni 2003.