Med Benfica vandt Pereira i 2010 det portugisiske mesterskab.
Landshold
Pereira står (pr. april 2018) noteret for hele 124 kampe og tre socringer for Uruguays landshold, som han debuterede for den 26. oktober2005 i en venskabskamp mod Mexico. Han var en del af den uruguayanske trup der nåede semifinalerne ved Copa América i 2007.