Martin Præstegaard (født 24. marts 1976 i Gentofte) er en dansk embedsmand. Han er pr. 1. juli 2022 udnævnt til administrerende direktør i Arbejdsmarkedets Tillægspension, hvor han tidligere var viceadministrerende direktør. Han er tidligere departementschef i Finansministeriet.

Han er uddannet cand.scient.pol. fra Københavns Universitet i 2002.

• Finansministeriet. "Departementschef Martin Præstegaard". Arkiveret fra originalen 25. februar 2016. Hentet 2016-01-19.altinget.dk (2016-01-03). "Martin Præstegaard". Hentet 2016-01-19.Finansministeriet (2019-06-18). "Finansministeriets departementschef bliver ny viceadministrerende direktør i ATP". Arkiveret fra originalen 11. juli 2019. Hentet 2019-07-11.