Kommunen ligger omkring seks kilometer nord for Erlangen i engene i Regnitzdalen, på den vestlige flodbred. Vest for Regnitz løber Main-Donau-Kanalen og den nu indlemmede landsby Kleinseebach, hvor floden Seebach munder ud i kanalen.
Til kommunen hører landsbyerne Möhrendorf, Kleinseebach, og bebyggelsen Oberndorf.
En seværdighed i Möhrendorf er de omkring 10 vandmøller ved Regnitz, der hører til de sidste af sin art i Centraleuropa . De øser det varme og næringsrige overfladevand op til overrisling af engene.
De ældste er anlagt i 1400-tallet, og i 1805 var der på en strækning af ca. 25 kilometer omkring 190 sådanne overrislingsanlæg, flere end ved nogen anden flod i centraleuropa.