RIG-I

protein DDX58

RIG-I (retinoic acid-inducible gene I) je spolu s MDA5 a LGP2 součástí skupiny RIG-I-like receptorů, která patří mezi cytoplazmatické pattern recognition receptory (PRR). RIG-I hraje klíčovou roli během antivirové obrany, neboť rozpoznává dvouřetězcovou RNA (dsRNA) [1]. Je exprimován v naprosté většině buněk s jádry, což napovídá jeho významné roli v boji proti virovým infekcím [2]. Jedná se o protein kódovaný u lidí genem DDX58 [1].

Struktura

RIG-I patří mezi ATP-dependentní DExD/H box RNA helikázy. Na svém N-konci má 2 CARD domény důležité pro signalizaci, helikázovou doménu, která je tvořena doménami nazvanými Hel1, Hel2 a Hel2i, na které navazuje C-terminální doména (CTD). Ta dokáže rozpoznat a navázat RNA[1][2] .

Funkce

RIG-I je pattern recognition receptor, který specificky rozeznává dsRNA o délce menší než 300 párů bází. Ideálním ligandem tohoto receptoru je tedy dsRNA, která má na svém 5'konci navázány tři fosfátové zbytky, přesto RIG-I dokáže rozeznat také RNA s 5´difosfátem[3]. Jakmile dojde k navázání ligandu, dojde ke změně konformace RIG-I, který přejde do aktivního stavu. Ten vede k tomu, že CARD domény RIG-I nyní mohou interagovat s CARD doménami mitochondriálních antivirových signálních proteinů (MAVS). CARD-CARD interakce spouští signální kaskády spojené s aktivací proteinkináz TBK1 a IKK. Tyto signální kaskády vedou k aktivaci transkripčních faktorů IRF3, IRF7 a NFκB, které translokují do jádra a indukují transkripci genů pro prozánětlivé cytokiny a interferony typu 1[4]. Produkované interferony se mohou vázat na své receptory na buněčném povrchu a kromě toho také aktivovat JAK/STAT dráhu vedoucí k produkci interferonem stimulovaných genů (ISG)[5]. Produkty těchto genů se podílejí na navození antivirového stavu, jehož následkem je omezení replikace viru a jeho šíření do okolních buněk[3].

Rozpoznávání virové infekce je hlavní, ne však jedinou rolí RIG-I receptorů. Bylo popsáno, že se uplatňují také při některých parazitárních a bakteriálních infekcích[6]. U bakteriálních infekcí se jedná především o rozpoznávání RNA intracelulárních bakterií uvolněných do cytoplazmy[7][8].

Regulace

Aktivita RIG-I je regulována řadou mechanismů, které zabraňují aktivaci receptoru při nepřítomnosti virové infekce, taková aktivace by měla za následek spuštění interferonové odpovědi a poškození buněk. Při virové infekci naopak podporují funkci receptoru.

Důležitou roli při aktivaci a deaktivaci RIG-I hrají posttranslační modifikace, mezi něž řadíme ubikvitinylaci, fosforylaci, sumoylaci a acetylaci. Tyto kovalentní modifikace jsou katalyzovány enzymy a mají vliv především na stabilitu a konformaci RIG-I. Dále se na regulaci podílí řada proteinů interagujících s RIG-I. Tyto proteiny modují schopnost RIG-I vázat se na RNA či jeho schopnost oligomerizovat, ovlivňují také lokalizaci receptoru v buňce[4][6]. Jako příklad lze uvést protein PACT, jenž interaguje s CTD RIG-I a podporuje jeho ATPázovou a helikázovou aktivitu, čímž se podílí na udržení aktivace antivirové obrany[9]. Aktivitu RIG-I ovlivňují také nekódující RNA, především dlouhá nekódující RNA (lncRNA) a microRNA (miRNA), a to prostřednictvím regulace genové exprese nebo přímou vazbou na receptor[4][6].

Onemocnění

Aktivace RIG-I v nepřítomnosti virové infekce hraje roli v patogenezi několika onemocnění. Důvodem aktivace může být mutace v genu kódujícím RIG-I vedoucí ke stálé aktivaci receptoru nebo rozpoznávání vlastních RNA způsobené například defekty v úpravě RNA či jejich špatnou lokalizací[4].

Atypický Singleton-Mertenův syndrom je autosomálně dominantní multisystémové dědičné onemocnění spojené s mutací v genu DDX58, což je gen kódující protein RIG-I. Mutace způsobuje vznik trvale aktivního receptoru, to má za následek stálou produkci interferonů typu I a prozánětlivých cytokinů[10].

Rozpoznávání endogenních RNA a aktivace RIG-I byla potvrzena u některých typů nádorových onemocnění. Indukce exprese interferonů typu 1 a prozánětlivých cytokinů podporuje aktivaci buněk imunitního systému a jejich migraci do místa nádoru. Zvýšení schopnosti antigen prezentujících buněk prezentovat antigen a podpora cytolytické aktivity NK buněk a cytotoxických T-lymfocytů hraje významnou roli v protinádorové imunitě[6]. Oproti tomu aktivace RIG-I u karcinomu prsu je spojena s růstem nádoru a podporuje tvorbu metastáz[11].

Reference

  1. ↑ a b c BRISSE, Morgan; LY, Hinh. Comparative Structure and Function Analysis of the RIG-I-Like Receptors: RIG-I and MDA5. Frontiers in Immunology. 2019, roč. 10, s. 1586. PMID: 31379819 PMCID: PMC6652118. Dostupné online [cit. 2022-02-06]. ISSN 1664-3224. DOI 10.3389/fimmu.2019.01586. 
  2. ↑ a b THORESEN, Daniel; WANG, Wenshuai; GALLS, Drew. The molecular mechanism of RIG-I activation and signaling. Immunological Reviews. 2021-11, roč. 304, čís. 1, s. 154–168. PMID: 34514601. Dostupné online [cit. 2022-02-06]. ISSN 1600-065X. DOI 10.1111/imr.13022. 
  3. ↑ a b KELL, Alison M.; GALE, Michael. RIG-I in RNA virus recognition. Virology. 2015-05, roč. 479-480, s. 110–121. PMID: 25749629 PMCID: PMC4424084. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1096-0341. DOI 10.1016/j.virol.2015.02.017. 
  4. ↑ a b c d REHWINKEL, Jan; GACK, Michaela U. RIG-I-like receptors: their regulation and roles in RNA sensing. Nature Reviews. Immunology. 2020-09, roč. 20, čís. 9, s. 537–551. PMID: 32203325 PMCID: PMC7094958. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1474-1741. DOI 10.1038/s41577-020-0288-3. 
  5. ↑ IVASHKIV, Lionel B.; DONLIN, Laura T. Regulation of type I interferon responses. Nature Reviews. Immunology. 2014-01, roč. 14, čís. 1, s. 36–49. PMID: 24362405 PMCID: PMC4084561. Dostupné online [cit. 2022-02-06]. ISSN 1474-1741. DOI 10.1038/nri3581. 
  6. ↑ a b c d SONG, Jie; LI, Muyuan; LI, Caiyan. Friend or foe: RIG- I like receptors and diseases. Autoimmunity Reviews. 2022-10, roč. 21, čís. 10, s. 103161. PMID: 35926770 PMCID: PMC9343065. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1873-0183. DOI 10.1016/j.autrev.2022.103161. 
  7. ↑ ABDULLAH, Zeinab; SCHLEE, Martin; ROTH, Susanne. RIG-I detects infection with live Listeria by sensing secreted bacterial nucleic acids. The EMBO journal. 2012-11-05, roč. 31, čís. 21, s. 4153–4164. PMID: 23064150 PMCID: PMC3492734. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1460-2075. DOI 10.1038/emboj.2012.274. 
  8. ↑ SCHMOLKE, Mirco; PATEL, Jenish R.; DE CASTRO, Elisa. RIG-I detects mRNA of intracellular Salmonella enterica serovar Typhimurium during bacterial infection. mBio. 2014-04-01, roč. 5, čís. 2, s. e01006–01014. PMID: 24692634 PMCID: PMC3977358. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 2150-7511. DOI 10.1128/mBio.01006-14. 
  9. ↑ KOK, Kin-Hang; LUI, Pak-Yin; NG, Ming-Him James. The double-stranded RNA-binding protein PACT functions as a cellular activator of RIG-I to facilitate innate antiviral response. Cell Host & Microbe. 2011-04-21, roč. 9, čís. 4, s. 299–309. PMID: 21501829. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1934-6069. DOI 10.1016/j.chom.2011.03.007. 
  10. ↑ JANG, Mi-Ae; KIM, Eun Kyoung; NOW, Hesung. Mutations in DDX58, which encodes RIG-I, cause atypical Singleton-Merten syndrome. American Journal of Human Genetics. 2015-02-05, roč. 96, čís. 2, s. 266–274. PMID: 25620203 PMCID: PMC4320253. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1537-6605. DOI 10.1016/j.ajhg.2014.11.019. 
  11. ↑ NABET, Barzin Y.; QIU, Yu; SHABASON, Jacob E. Exosome RNA Unshielding Couples Stromal Activation to Pattern Recognition Receptor Signaling in Cancer. Cell. 2017-07-13, roč. 170, čís. 2, s. 352–366.e13. PMID: 28709002 PMCID: PMC6611169. Dostupné online [cit. 2023-01-31]. ISSN 1097-4172. DOI 10.1016/j.cell.2017.06.031. 

Read other articles:

Ekonomi Anak Macan

Ekonomi Anak Macan (kuning) terdiri dari empat negara, Indonesia, Malaysia, Filipina, Vietnam, dan Thailand. Ditunjukkan pula Empat Macan Asia (merah). Istilah Ekonomi Anak Macan secara kolektif mengacu pada ekonomi Indonesia, Malaysia, Filipina, Vietnam,[1] dan Thailand, lima negara yang mendominasi Asia Tenggara.[2] Ekonomi Anak Macan diberi nama demikian karena keempat negara ini mengikuti model pembangunan ekonomi berorientasi ekspor yang dijalankan Hong Kong, Singapura, K...

 

Barneveld

BarneveldMunicipality BenderaLambang kebesaranCountryNetherlandsProvinceGelderlandPemerintahan • MayorAsje van Dijk (CDA)Luas(2006) • Total176,74 km2 (6,824 sq mi) • Luas daratan176,02 km2 (6,796 sq mi) • Luas perairan0,72 km2 (28 sq mi)Populasi (June 2010) • Total52.629 Source: municipality of Barneveld.Zona waktuUTC+1 (CET) • Musim panas (DST)UTC+2 (CEST) Barneveld ...

 

Imabari, Ehime

City in Shikoku, JapanImabari 今治市CityView of Seto Inner Sea and downtown Imabari FlagEmblemLocation of Imabari in Ehime PrefectureImabariLocation in JapanCoordinates: 34°4′N 133°0′E / 34.067°N 133.000°E / 34.067; 133.000CountryJapanRegionShikokuPrefectureEhime PrefectureGovernment • MayorShigeki Tokunaga (since February 2021)Area • Total419.14 km2 (161.83 sq mi)Population (August 31, 2012) • Total152...

Hangony

This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: Hangony – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (September 2020) (Learn how and when to remove this template message) Village in Northern Hungary, HungaryHangonyVillage FlagCoat of armsHangonyLocation of HangonyCoordinates: 48°13′46″N 20°11′51″E...

 

Nicolò Brighenti

Nicolò Brighenti Brighenti (a destra) esulta con Stefano Giacomelli durante una partita con il Vicenza nel 2015 Nazionalità  Italia Altezza 178 cm Peso 75 kg Calcio Ruolo Difensore Squadra  Catanzaro Carriera Giovanili 2003-2006 Chievo Squadre di club1 2006-2007 Chievo0 (0)2008-2009→  Mezzocorona23 (0)2009 Triestina0 (0)2009-2010→  Pergocrema4 (0)2010 Chievo0 (0)2010-2012→  Viareggio42 (0)[1]2012-2013 Vicenza36 (1)[2]2...

 

Alevisme Kurdi

Rêya HeqîPir Sultan AbdalKitab suciQuran, Nahj al-Balagha, Makalat dan BuyruksPemimpinOcaxAjaran dariImam Ali, Pir Sultan AbdalWilayahTurkiBahasaBahasa Kurmanji, dan bahasa Zaza[1]LiturgiJem, SamāhKantor pusatProvinsi Tunceli, TurkiPendiriPir Sultan AbdalTerpisah dariSunni, Syiah Imamiyah dan Alevi TurkiNama lainAlevisme Kurdi Alevisme Kurdi[2] (bahasa Kurdi: Rêya Heqî, har. ''Jalan Tuhan/Kebenaran'')[2] mengacu pada praktik ritual unik, tempat su...

Skeffington Hall

Skeffington Hall Skeffington Hall is a 15th-century Manor House which stands in parkland off the main street of the village of Skeffington, Leicestershire, England. It is a Grade II* listed building and is privately owned.[1] The house was originally constructed in about 1450 and extended c1530 and again in the early or mid 17th century. It is built to an H-shaped plan in two storeys of coursed ironstone rubble with white limestone ashlar dressings and Swithland slate roofs. The main ...

 

Albuquerque International Sunport

Airport in Albuquerque, New Mexico, United States For the USAF use of this facility, see Kirtland Air Force Base. For the former airport serving Albuquerque, see Oxnard Field. For the ABC television station serving Brisbane, see ABQ. Albuquerque International SunportIATA: ABQICAO: KABQFAA LID: ABQWMO: 72365SummaryAirport typeMilitary/PublicOwnerCity of Albuquerque, New Mexico, United StatesOperatorAlbuquerque Aviation DepartmentServesAlbuquerque metropolitan areaLocation2200 Sunport Boulevard...

 

Gort

Town in County Galway, Ireland This article is about the town in Galway. For other uses, see Gort (disambiguation). Town in Connacht, IrelandGort Gort Inse GuaireTownBridge Street, Gort in 2007.GortLocation in IrelandCoordinates: 53°03′58″N 8°49′05″W / 53.066°N 8.818°W / 53.066; -8.818CountryIrelandProvinceConnachtCountyCounty GalwayElevation43 m (141 ft)Population (2022)[1]2,870Time zoneUTC±0 (WET) • Summer (DST)UTC+1 (I...

Шалфей обыкновенный

Шалфей обыкновенный Научная классификация Домен:ЭукариотыЦарство:РастенияКлада:Цветковые растенияКлада:ЭвдикотыКлада:СуперастеридыКлада:АстеридыКлада:ЛамиидыПорядок:ЯсноткоцветныеСемейство:ЯснотковыеРод:ШалфейВид:Шалфей обыкновенный Международное научное наз...

 

Folco V d'Angiò

Folco d'AngiòIl re Folco in una miniatura del XIII secoloRe di GerusalemmeStemma In carica21 agosto 1131 –13 novembre 1143(con la moglie Melisenda) Incoronazione14 settembre 1131 PredecessoreBaldovino II SuccessoreBaldovino III con Melisenda Conte d'Angiòcome Folco VIn carica1109 –1129 PredecessoreFolco IV SuccessoreGoffredo V Conte del Mainecome Folco IIn carica1110 –1129(con la moglie Eremburga fino al 1126) PredecessoreElia I SuccessoreGoffredo I NascitaAngers,...

 

Антитринитаризм

ХристианствоБиблия Ветхий Завет Новый Завет Евангелие Десять заповедей Нагорная проповедь Апокрифы Бог, Троица Бог Отец Иисус Христос Святой Дух История христианства Апостолы Хронология христианства Раннее христианство Гностическое христианство Вселенские соборы Н...

Charles Lanrezac

Charles LanrezacBorn31 July 1852 (1852-07-31)Pointe-à-Pitre, GuadeloupeDied18 January 1925 (1925-01-19) (aged 72)Neuilly-sur-Seine, FranceAllegiance FranceYears of service1869–1914RankGénéral de DivisionCommands held11th Army CorpsFifth ArmyBattles/warsFranco-Prussian WarWorld War IAwardsGrand cross of the Légion d'honneurGrand cross of the Order of the Crown (Belgium) Charles Lanrezac (31 July 1852 – 18 January 1925) was a French general, formerly a distinguished ...

 

Rotor transverse (melintang)

Rotor transverse adalah sebuah pesawat rotor yang memiliki dua rotor besar horisontal yang dipasang berdampingan. Helikopter rotor tunggal membutuhkan rotor ekor untuk menetralisir saat memutar yang dihasilkan oleh rotor tunggal yang besar. Helikopter rotor tandem, menggunakan counter-rotating rotor, dengan masing-masing membatalkan keluar torsi yang lain. Counter-rotating baling-baling tidak akan bertabrakan dengan dan menghancurkan satu sama lain jika mereka melenturkan ke jalur rotor lain...

 

Star Wars: The Clone Wars (Fernsehserie)/Episodenliste

Logo zur Serie Diese Episodenliste enthält alle Episoden der US-amerikanischen Computeranimationsserie Star Wars: The Clone Wars, sortiert nach der US-amerikanischen Erstausstrahlung. Zwischen 2008 und 2014 entstanden neben dem gleichnamigen Film eine Fernsehserie mit sechs Staffeln und insgesamt 121 Episoden mit einer Länge von jeweils etwa 21 Minuten. Für 2020 wurden 12 weitere Episoden für eine siebte und finale Staffel bestätigt. Damit wurde die Serie mit 133 Episoden in sieben Staff...

Haramaya University

University in Haramaya, Oromia Region, Ethiopia Haramaya UniversityUnivarsiitii HaramayaaMottoBuilding the basis for development!TypeNationalEstablished1954PresidentJemal Yousuf HassenAdministrative staff5,290Total staff7,850Students30,355 (2017/18)LocationHaramaya, Oromia Region, Ethiopia9°25′24″N 42°02′14″E / 9.4233°N 42.0372°E / 9.4233; 42.0372LanguageEnglishColours  Light greenWebsitewww.haramaya.edu.etLocation in Ethiopia Haramaya University (HU) ...

 

Saurimo

Town in Lunda Sul, northeastern Angola This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: Saurimo – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (April 2023) (Learn how and when to remove this message)Municipality in Lunda Sul Province, AngolaSaurimo Henrique de CarvalhoMunicipalitySaurimoLocation in AngolaCoord...

 

Referendum in Danimarca del 1972

Il referendum in Danimarca del 1972 si tenne il 2 ottobre ed ebbe ad oggetto l'adesione del Paese alla Comunità economica europea. Esso vide la prevalenza dei sì col 63,3%; l'affluenza alle urne fu del 90,1%. La legge di ratifica del Trattato di adesione alle Comunità europee fu approvata dal Folketing il successivo 11 ottobre e la Danimarca aderì alla Comunità europea il 1º gennaio 1973, assieme all'Irlanda ed al Regno Unito. Indice 1 Contesto 2 Risultati 3 Voci correlate 4 Collegament...

Damian Marley

Jamaican DJ, singer and rapper (born 1978) Damian MarleyMarley performing in 2015Background informationBirth nameDamian Robert Nesta MarleyAlso known asJr. GongBorn (1978-07-21) 21 July 1978 (age 45)Kingston, JamaicaGenres Reggae reggae fusion hip hop Occupation(s) Deejay rapper singer songwriter Years active1992–presentLabels Tuff Gong Ghetto Youth International Motown Republic Musical artist Damian Robert Nesta Jr. Gong Marley (born 21 July 1978) is a Jamaican DJ, singer, lyricist an...

 

Ton (massa)

Grotere en kleinere eenheden van gram en ton fac­tor naam sym­bool   10−30 quectogram qg 10−27 rontogram rg 10−24 yoctogram yg 10−21 zeptogram zg 10−18 attogram ag 10−15 femtogram fg 10−12 picogram pg 10−9 nanogram ng 10−6 microgram µg 10−3 milligram mg 10−2 centigram cg 10−1 decigram dg 1 gram g 101 decagram dag 102 hectogram hg fac­tor naam sym­bool 103 kilogram kg 106 megagram Mg 1 ton t 109 gigagram Gg 103 kiloton kt 1012 teragram Tg 106 ...