Operace byla zahájena v ranních hodinách 1. března 2002, již v prvních hodinách útoku však narazily koaliční jednotky na nečekané problémy. Namísto odhadovaných dvou set bojovníků se jich v údolí nacházelo zhruba pětkrát tolik. Ti byli navíc překvapivě silně vyzbrojeni, disponovali i těžšími zbraněmi v podobě raketometů a minometů a perfektně znali terén. Afghánské milice při útoku ze severu utrpěly vážné ztráty, zatímco na americké vrtulníky vysazující vojáky na jižním konci údolí čekala hustá protiletecká palba. Jen s vypětím všech sil a za vydatné vzdušné podpory se Američanům podařilo dosáhnout plánovaných pozic.[1]
Operace Anakonda skončila vítězstvím koalice a americkým a afghánským silám se podařilo vyhnat většinu příslušníků al-Káidy a Talibanu z údolí Shahi-Kot. Ztráty na americké straně tvořilo pouze 8 padlých a 82 raněných. Odhadované ztráty al-Káidy a Talibanu jsou v rozsahu od 100-800(1000) vojáků. Neznámému počtu rebelů se podařilo z údolí uprchnout do Pákistánu.[2]
