V soubojích 26. ročníku Moravskoslezské fotbalové ligy 2016/17 se utkalo 16 týmů každý s každým dvoukolovým systémem podzim–jaro. Tento ročník odstartoval v pátek 5. srpna 2016 úvodním zápasem 1. kola, ve kterém SK Spartak Hulín porazil na svém hřišti HFK Třebíč 3:1 (poločas 1:0).[1] Ročník skončil v sobotu 10. června 2017 zbývajícím zápasem 29. kola (30. kolo bylo předehráno v květnu 2017), ve kterém 1. HFK Olomouc porazil na svém hřišti 1. FC Slovácko „B“ 4:0 (poločas 3:0).[2]
Vzhledem k tomu, že z II. ligy sestoupila 2 mužstva z Moravy a Slezska, sestoupila z tohoto ročníku MSFL poslední 3 mužstva.
Vítězný klub SK Uničov se postupu do druhé nejvyšší soutěže vzdal. B-mužstva prvoligových týmů (Olomouc B, Slovácko B, Zlín B) byla po skončení ročníku odhlášena. Slovácko B hrálo v sezoně 2017/18 1. B třídu Zlínského kraje jakožto bývalé C mužstvo.
Z = Odehrané zápasy; V = Vítězství; R = Remízy; P = Prohry; VG = Vstřelené góly; OG = Obdržené góly; B = Body; (N) = nováček (minulou sezónu hrál nižší soutěž a postoupil)