V soubojích fotbalové II. třídy okresu Havlíčkův Brod 2003/2004, jedné ze skupin 8. nejvyšší fotbalové soutěže, se utkalo 14 týmů dvoukolovým systémem podzim – jaro. Tento ročník skončil v červnu 2004. Postup do I. B třídy Kraje Vysočina 2004/2005 si zajistily první dva týmy TJ Sokol Pohled a TJ Sokol Štoky, sestoupil poslední tým Viktorie Jeřišno.
Z = Odehrané zápasy; V = Vítězství; R = Remízy; P = Prohry; VG = Vstřelené góly; OG = Obdržené góly; B = Body; (S) = Mužstvo sestoupivší z vyšší soutěže; (N) = Mužstvo postoupivší z nižší soutěže (nováček)