V soubojích fotbalové II. třídy okresu Děčín 2003/2004, jedné ze skupin 8. nejvyšší fotbalové soutěže, se utkalo 16 týmů dvoukolovým systémem podzim – jaro. Tento ročník skončil v červnu 2004. Postup si zajistily první dva týmy TJ Union Děčín a FK Dolní Poustevna, sestoupil poslední tým FK Chřibská.
Z = Odehrané zápasy; V = Vítězství; R = Remízy; P = Prohry; VG = Vstřelené góly; OG = Obdržené góly; B = Body; (S) = Mužstvo sestoupivší z vyšší soutěže; (N) = Mužstvo postoupivší z nižší soutěže (nováček)