Oproti knize bylo pouze naznačeno spojení mezi Harryho otcem a Pobertovým plánkem, značně je zkrácena pasáž v Chroptící chýši. Nebyl vysvětlen způsob Siriusova útěku z Azkabanu. Ve vlaku, kde hlavní trojice cestovala s Lupinem, byli v knize i Ginny Weasleyová a Neville Longbottom. Vynechány jsou také famfrpálové zápasy Nebelvíru proti Zmijozelu a Havraspáru, i když právě v tomto díle Nebelvír konečně vyhrál famfrpálový pohár. V knize při hodině péče o kouzelné tvory přivede Hagrid 12 hipogryfů místo jednoho. Vynecháno je také mnoho vyučovacích hodin, vysvětlení, co to vlastně je Fideliovo zaklínadlo (neznalý knihy tak z filmu neví, jak měl vlastně Sirius Potterovy zradit). Také, když se Harry a Hermiona vrací v čase, v knize dávají velký pozor na to, aby do ničeho nezasahovali, ve filmu házejí kameny do Hagridovy boudy, vyjí, aby nalákali vlkodlaka. Vynechána je také Cho Changová a Harryho první setkání s ní.