Studoval medicínu na Univerzitě v Cambridgi, kde nastoupil do tamní univerzitní komediální skupiny Cambridge Footlights. Postupem času se stal silným alkoholikem. Během nejhoršího období svého alkoholismu vypil až přes dva litry ginu denně. Z alkoholismu se vyléčil před natáčením filmu Monty Python: Život Briana a od té doby se stal zatvrzelým abstinentem. Byl homosexuál a přes 20 let žil se svým přítelem Davidem Sherlockem a společně adoptovali chlapce jménem John Tomiczek. Graham Chapman zemřel na rakovinu hrtanu s metastatickým postižením míchy.