Firma byla založena roku 1969 brazilským Ministerstvem letectví. V devadesátých letech se Embraer stal významným hráčem mezi leteckými výrobci svým modelem ERJ-145, kterého bylo prodáno více než 900 kusů. V roce 2001 obrat firmy činil 2,9 miliardy USD, čistý zisk 468 miliónů a společnost vykazuje zásobu objednávek v hodnotě 23,4 miliard dolarů.