La Soiuz TM-31 va ser el primer vol d'una nau espacial Soiuz en acoblar-se amb l'Estació Espacial Internacional (ISS).[1] Va ser llançat a finals del 2000 amb una nau Soiuz-TM transportant a l'Expedició 1 de l'ISS, la primera tripulació de llarga duració de l'ISS. Va ser llançat des de Rússia a les 07:52 UT el 31 d'octubre de 2000 per un coet Soiuz-U.
La tripulació consistia en dos cosmonautes russos Iuri Guidzenko i Serguei Krikaliov, i l'astronauta estatunidencWilliam Shepherd. Guidzenko va ser el Comandant de la tripulació, però un cop a bord de l'estació, Shepherd es va convertir en Comandant de la missió de llarga duració, l'Expedició 1.[2]
La nau espacial va servir com a vehicle d'escapada d'emergència de la tripulació mentre va romandre acoblada a l'ISS. La tripulació de l'Expedició 1 va tornar a la Terra a través del Transbordador Espacial durant el STS-102 en el març del 2001, i la nau Soiuz TM-31 es va mantenir a l'estació disponible per a l'Expedició 2. A l'abril de 2001 una altra nau espacial, la Soiuz TM-32, va arribar a l'estació, i va assumir responsabilitats com a bot salvavides de l'estació. La tripulació va ser enlairada per una Soiuz TM-32, que va incloure el primer turista espacial pagant, en Dennis Tito, que va tornar a la Terra al maig a bord del Soiuz TM-31. La missió de visita en què Tito formava part que es denomina de vegades ISS EP-1.
Les càrregues són separades per símbols en forma de bales ( · ), els llançaments per símbols en forma de canonades ( | ). Els vols tripulats s'indiquen en negreta. Els vols sense catalogar i llançaments fallits apareixen en cursiva. Les càrregues implementades des d'una altra nau espacial s'indiquen entre parèntesis.