El 13 d'agost de 1922 el doctor en Medicina Juan Nogueres funda el Jaén F.C. Existia aquells anys un altre club a la ciutat, la Unión Deportiva. El club es federa el 1923. El 12 de juny de 1929 es reconstitueix amb el nom de Sociedad Olímpica Jiennense, que debuta a Tercera Regional. L'uniforme d'aquell equip era samarreta vermella i pantalons blaus. El 1939 s'abandona el color vermell adoptant-se el blanc. El 5 de setembre de 1947 la Federació Espanyola de Futbol va autoritzar un nou nom pel club, Real Jaén, i es va establir definitivament el color blanc per a la primera vestimenta de l'equip. Als anys 50 va jugar tres temporades a la primera divisió del futbol espanyol (1953-54, 1956-57, 1957-58).
El 3 de febrer de 2011, el consell d'administració de l'equip, presidit per Rafael Teruel, va anunciar que la societat s'acolliria a la Llei concursal, donada la seva situació d'insolvència econòmica. El club deu a Hisenda i la Seguretat Social uns vuit milions d'euros.[1]
