Hi ha 5 parcs nacionals a Lituània. Es van establir el 1991 després que Lituània declarés la seva independència de la Unió Soviètica el 1990. El Parc Nacional de la República Socialista Soviètica de Lituània establert el 1974 es va reorganitzar i va passar a dir-se Parc Nacional Aukštaitija. Ara els parcs nacionals cobreixen aproximadament el 2,3 per cent del territori de Lituània.