Està regit per una Junta Rectora que delega part de les seves funcions en la direcció executiva, ambdues assessorades per juntes de govern consultives i de publicacions. Des de 1956 organitza cada cinc anys un Curs Internacional d'Oftalmologia de reconegut prestigi internacional, i inclou conferències i taules rodones. També atorga una Medalla d'Or.