El club es fundà l'1 de novembre de 1954 com la societat poliesportiva Sportclub Empor Rostock. La secció de futbol nasqué de la transferència del club BSG Empor Lauter de la ciutat de Lauter a Rostock, pràctica comuna a la RDA aquells anys. Aquesta transferència es produí la temporada 1954-55. El 1956 es formà un nou club anomenat BSG Motor Lauter.
La reorganització del futbol de la RDA el 1965 portà a la separació de la secció de futbol en un club independent i el 28 de desembre nasqué el Fußball Club Hansa Rostock.