Rođen 1931. godine, Manabe je doktorirao. sa Univerziteta u Tokiju 1958. godine i otišao u Sjedinjene Američke Države na rad u Odsjek za istraživanje opće cirkulacije američkog meteorološkog biroa, sada laboratorija za geofizičku dinamiku fluida NOAA, koji je trajao do 1997. godine. Od 1997. do 2001. radio je u Frontier Research System -u za globalne promjene u Japanu na poziciji direktora Odjela za istraživanje globalnog zagrijavanja. Godine 2002. vratio se u Sjedinjene Države kao gostujući istraživački saradnik na Programu za nauku o atmosferi i okeanu, Univerzitet Princeton . Trenutno radi kao viši meteorolog na univerzitetu.