MTAP

MTAP
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1SD1, 3OZD, 3OZC, 3LN5, 3OZE, 1SD2, 1CB0, 1CG6, 1K27

Identifikatori
AliasiMTAP
Vanjski ID-jeviOMIM: 156540 MGI: 1914152 HomoloGene: 1838 GeneCards: MTAP
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za MTAP
Genomska lokacija za MTAP
Bend9p21.3Početak21,802,636 bp[1]
Kraj21,937,651 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za MTAP
Genomska lokacija za MTAP
Bend4|4 C4Početak89,055,359 bp[2]
Kraj89,099,318 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
glycosyltransferase activity
1,4-alpha-oligoglucan phosphorylase activity
catalytic activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
pentosyltransferase activity
S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase activity
Ćelijska komponenta Egzosom
jedro
citosol
citoplazma
Biološki proces L-methionine salvage from methylthioadenosine
purine ribonucleoside salvage
nucleoside metabolic process
nicotinamide riboside catabolic process
nucleobase-containing compound metabolic process
interleukin-12-mediated signaling pathway
Metilacija
response to testosterone
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_002451

NM_024433

RefSeq (bjelančevina)

NP_002442

NP_077753

Lokacija (UCSC)Chr 9: 21.8 – 21.94 MbChr 4: 89.06 – 89.1 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

S-metil-5'-tioadenozin fosforilaza je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MTAP.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 283 aminokiseline, а molekulska težina 31.236 Da.[7]

1020304050
MASGTTTTAVKIGIIGGTGLDDPEILEGRTEKYVDTPFGKPSDALILGKI
KNVDCVLLARHGRQHTIMPSKVNYQANIWALKEEGCTHVIVTTACGSLRE
EIQPGDIVIIDQFIDRTTMRPQSFYDGSHSCARGVCHIPMAEPFCPKTRE
VLIETAKKLGLRCHSKGTMVTIEGPRFSSRAESFMFRTWGADVINMTTVP
EVVLAKEAGICYASIAMATDYDCWKEHEEAVSVDRVLKTLKENANKAKSL
LLTTIPQIGSTEWSETLHNLKNMAQFSVLLPRH

Funkcija

Ovaj ge kodira enzim koji ima glavnu ulogu u matabolizmu poiliamina i važan je za spašavanje adenina i metionina. Kodirani enzim nedostaje u mnogim tipovima raka jer se ovaj gen i supresor tumora p16gen kodeletiraju. Za ovaj gen opisano je više alternativno prerađenih varijanti transkripta, ali njihova priroda u punoj dužini ostaje nepoznata.[6]

Reference

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000099810 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062937 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Schmid M, Sen M, Rosenbach MD, Carrera CJ, Friedman H, Carson DA (Dec 2000). "A methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) fusion transcript identifies a new gene on chromosome 9p21 that is frequently deleted in cancer". Oncogene. 19 (50): 5747–54. doi:10.1038/sj.onc.1203942. PMID 11126361.
  6. ^ a b "Entrez Gene: MTAP methylthioadenosine phosphorylase".
  7. ^ "UniProt, Q13126". Pristupljeno 10. 9. 2021.

Dopunska literatura

Vanjski linkovi